Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpraQ9DBG7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms