Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Smg9Q9DB90 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Smg9Q9DB90 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smg9Q9DB90 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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