Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Med27Q9DB40 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms