Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
H2al1mQ9DAD9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
H2al1mQ9DAD9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms