Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sgf29Q9DA08 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sgf29Q9DA08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms