Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib4Q9D9N5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms