Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Cldn34b2Q9D9N2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b2Q9D9N2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b2Q9D9N2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms