Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D9H8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D9H8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D9H8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D9H8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms