Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms