Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TcimQ9D915 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TcimQ9D915 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms