Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot8Q9D8X5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot8Q9D8X5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms