Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SlirpQ9D8T7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms