Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fip1l1Q9D824 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms