Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Capn9Q9D805 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Capn9Q9D805 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms