Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbe1Q9D6Y9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbe1Q9D6Y9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms