Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tube1Q9D6T1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tube1Q9D6T1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms