Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ca13Q9D6N1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ca13Q9D6N1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms