Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms