Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc9bQ9D6E4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms