Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D5Q8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D5Q8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms