Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930564D02RikQ9D4S4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms