Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms