Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms