Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D454 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D454 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D454 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D454 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D454 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D454 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D454 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D454 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms