Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tchhl1Q9D3P1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tchhl1Q9D3P1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms