Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stag1Q9D3E6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms