Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z4

Senp8, Sentrin-specific protease 8, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp8Q9D2Z4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Senp8Q9D2Z4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms