Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D2Q3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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