Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Fndc8Q9D2H8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fndc8Q9D2H8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Fndc8Q9D2H8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Fndc8Q9D2H8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fndc8Q9D2H8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fndc8Q9D2H8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fndc8Q9D2H8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fndc8Q9D2H8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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