Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tssk3Q9D2E1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tssk3Q9D2E1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms