Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Creb3l4Q9D2A5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms