Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc6bQ9D289 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc6bQ9D289 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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