Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spns3Q9D232 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spns3Q9D232 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms