Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chordc1Q9D1P4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms