Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Necap2Q9D1J1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Necap2Q9D1J1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Necap2Q9D1J1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Necap2Q9D1J1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Necap2Q9D1J1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Necap2Q9D1J1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms