Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms