Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Zbed3Q9D0L1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Zbed3Q9D0L1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Zbed3Q9D0L1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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