Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NkapQ9D0F4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NkapQ9D0F4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms