Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2e1Q9D0D5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms