Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snf8Q9CZ28 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms