Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms