Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxxc1Q9CWW7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms