Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sycp2Q9CUU3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms