Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms