Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms