Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhobtb3Q9CTN4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms