Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms