Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9CR55 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9CR55 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CR55 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CR55 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CR55 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CR55 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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