Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl28Q9CR40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms