Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dph2Q9CR25 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Dph2Q9CR25 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Dph2Q9CR25 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dph2Q9CR25 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms